More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5353 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  39.69 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  36.92 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1950  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  35.46 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.06 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.13 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  30.13 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  30.77 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  30.13 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  30.77 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  30.77 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  29.45 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  28.77 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  28.77 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  28.77 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  28.77 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  34.41 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 188 aa  52  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  33.68 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>