More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3095 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 259 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 242 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  43.66 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 231 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  39.58 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 290 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  28.19 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  32.32 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  31 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
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NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
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