More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1179 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 216 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 210 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7278  Transcriptional regulator  26.29 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 192 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 187 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 205 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 198 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  35.82 
 
 		 231 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  41.38 
 
 		 190 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 194 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 199 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 205 aa  52.8  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  52.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 233 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  37.18 
 
 		 186 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 235 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 183 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 242 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  40.32 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 193 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 205 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 203 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 188 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  21.88 
 
 		 238 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 200 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 211 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 324 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 208 aa  49.3  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 203 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 234 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 233 aa  48.9  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 216 aa  48.9  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 195 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.99 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>