More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3516 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 305 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 237 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7278  Transcriptional regulator  30.57 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  32.54 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  22.62 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  32.32 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1650  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
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NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
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NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  32.29 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
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