86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3022 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  99.57 
 
 		 275 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1650  TetR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7278  Transcriptional regulator  31.41 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 237 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 187 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 191 aa  46.6  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1910  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0010144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 497 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  21.55 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  22.8 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 262 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  43.14 
 
 		 189 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  21.64 
 
 		 201 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 248 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 212 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 214 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 266 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  43.75 
 
 		 246 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>