93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3028 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7278  Transcriptional regulator  29.82 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 305 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  20.37 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  20.37 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  48 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  19.75 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  42.62 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 72 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  27.43 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 324 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1805  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  34.12 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 286 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  32.5 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 188 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 202 aa  42  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 202 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 232 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 192 aa  42  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 219 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 229 aa  41.6  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 246 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 200 aa  41.2  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 246 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 246 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>