More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0153 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  67.02 
 
 		 204 aa  259  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  61.98 
 
 		 205 aa  257  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  58.85 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 218 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  50.26 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  40.62 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0133  TetR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  33.7 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  26.83 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  25.95 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 242 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  39.77 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 286 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  34.52 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 324 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 256 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 438 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>