More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7278 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7278  Transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 305 aa  95.9  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 275 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1650  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
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NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2000  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  38.96 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  37.66 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  36.92 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  32.22 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  32.5 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
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NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
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NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
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NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
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NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
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NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
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NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
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