More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5271 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  44.13 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 254 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  33.54 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 297 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  28.49 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7278  Transcriptional regulator  30.57 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 273 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  32 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  30.63 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3444  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  37.31 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2527  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 176 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>