More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3152 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  43.89 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  46.74 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  41.22 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 200 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 202 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 202 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 201 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 193 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 201 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4693  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53550  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00980972  decreased coverage  0.0000958508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  47.92 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  40.85 
 
 		 186 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  28.44 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  38.57 
 
 		 203 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4631  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 226 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 205 aa  49.3  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 191 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 220 aa  48.9  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 191 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 191 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  26.56 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>