111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3363 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  48 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  45.69 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 497 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  29.46 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  31.54 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  38.18 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 446 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  34.38 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2712  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 269 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 248 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 248 aa  42.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8756  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0874834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  44 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 269 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 218 aa  42  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 215 aa  42  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 268 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  29.51 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 208 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 307 aa  42  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3419  transcription regulation protein  22.62 
 
 		 201 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.909274  normal  0.462694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 205 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>