33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8756 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8756  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0874834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0896  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00832617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  28.67 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  28.14 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  23.35 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  29.27 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 497 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  40.38 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 190 aa  42  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 208 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1714  hypothetical protein  43.75 
 
 		 152 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 222 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1922  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 446 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>