148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10136 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  100 
 
 
201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  64.92 
 
 
193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  64.92 
 
 
201 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  64.92 
 
 
193 aa  251  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  61.88 
 
 
185 aa  217  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  58.68 
 
 
198 aa  201  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  52.69 
 
 
192 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
190 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  48 
 
 
213 aa  174  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  47.85 
 
 
196 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 
228 aa  147  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
213 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
212 aa  98.6  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
206 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  29.01 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 
220 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 
204 aa  52  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30.68 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 
184 aa  49.3  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 
190 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  40 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
213 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  40 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  30 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.89 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  32.58 
 
 
196 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 
211 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
497 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
241 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
770 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4778  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 
202 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329745 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  27.44 
 
 
215 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  30 
 
 
224 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 
204 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
215 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 
215 aa  44.7  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  32.18 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
251 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 
225 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  30 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
243 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>