184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2639 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  383  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 192 aa  211  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  58.15 
 
 		 190 aa  208  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 224 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 224 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  50.27 
 
 		 193 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  50.27 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  50.27 
 
 		 193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  47.85 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  45.69 
 
 		 213 aa  161  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  40.53 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 217 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  18.33 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 216 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  36.67 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8756  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0874834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 335 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 330 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 225 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  21.88 
 
 		 251 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  34.25 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  53.49 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  53.49 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>