More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3166 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 234 aa  453  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  49.08 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  45.41 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  42.79 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 211 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 271 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 200 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  30.54 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  31.13 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  30 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 199 aa  52.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  34.52 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  30.41 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  24.42 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 288 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 184 aa  48.9  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 199 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  34.21 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>