168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2767 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  362  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  362  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  362  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  58.92 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  28.92 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  21.02 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  56.52 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  20.69 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  21.21 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  18.29 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  24.71 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  35.83 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  44.68 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  39.66 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  19.02 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  25.29 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  17.82 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 257 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0774  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  17.28 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  35.09 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  26.04 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  18.06 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  20.93 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  21.9 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  16.67 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 242 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  24.1 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>