219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5172 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 202 aa  270  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  41.43 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  25.71 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  33.72 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  39.08 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  30.67 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 249 aa  48.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  18.86 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  18.86 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  18.86 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.42 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  18.86 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  18.86 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  18.86 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  18.86 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  18.86 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  31.96 
 
 		 278 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 497 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  18.86 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>