105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5042 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
225 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  92.2 
 
 
219 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  91.28 
 
 
218 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  89.91 
 
 
218 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  91.12 
 
 
218 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  91.12 
 
 
218 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  91.39 
 
 
213 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  72.02 
 
 
222 aa  314  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  69.64 
 
 
222 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  69.64 
 
 
222 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  69.64 
 
 
221 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  70.14 
 
 
222 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  68.95 
 
 
216 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  68.95 
 
 
216 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  68.95 
 
 
216 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  68.95 
 
 
217 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  70.14 
 
 
222 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
221 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
199 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  34.33 
 
 
205 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  30.46 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  36.84 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  30.69 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  33.33 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  36.36 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
232 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
193 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  27.46 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
192 aa  51.6  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
203 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
201 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
211 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
198 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
209 aa  45.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
211 aa  45.1  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18610  transcriptional regulator, tetR family  35.8 
 
 
89 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.514394  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
195 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
195 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
193 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
235 aa  42  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
212 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
229 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
214 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 
207 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.362049 
 
 
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NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 
211 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal 
 
 
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NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 
196 aa  42  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
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