118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18610 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18610  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 89 aa  186  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1447  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 215 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.456652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 181 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  51.16 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 215 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 332 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  36.07 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 211 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  46.51 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 211 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  40 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  44.19 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  36.67 
 
 		 289 aa  44.7  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 193 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  48.78 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 226 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 228 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 205 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 243 aa  42.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 202 aa  42.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 183 aa  42.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 222 aa  42  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 222 aa  42  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 196 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 222 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 196 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 202 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 202 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 222 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  32.79 
 
 		 223 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 188 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 213 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 335 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1272  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 226 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  41.3 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  40.35 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 287 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  35 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  41.3 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2300  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 229 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>