More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0108 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  430  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  96.4 
 
 		 222 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  89.9 
 
 		 222 aa  344  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  79.36 
 
 		 222 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  88.94 
 
 		 222 aa  318  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  89.9 
 
 		 222 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  89.9 
 
 		 222 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  63.59 
 
 		 232 aa  248  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0159  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 202 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 231 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  44.05 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  41.23 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  41.79 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  45.35 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  40.58 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  39.19 
 
 		 258 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  39.73 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>