More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3341 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  29.56 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  44.78 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  35.23 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  37.14 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  35.37 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  25.74 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 74 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  31.51 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  28 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
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NC_010815  Glov_3704  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.21281 
 
 
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NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  24.8 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
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