More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0118 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  89.55 
 
 		 222 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  93.27 
 
 		 222 aa  352  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  88.18 
 
 		 222 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  98.08 
 
 		 222 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  79.82 
 
 		 222 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  64.98 
 
 		 232 aa  247  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  66.51 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  66.51 
 
 		 228 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  66.51 
 
 		 228 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  66.51 
 
 		 228 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  66.51 
 
 		 228 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  66.51 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0159  TetR family transcriptional regulator  66.51 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  62  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  44.05 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  41.18 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  38.53 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 273 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  36.67 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  36.47 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>