163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3816 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0159  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 228 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 228 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 228 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 228 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 202 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  33.9 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  40.85 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 74 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  33.68 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 174 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  25.22 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 290 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6153  regulatory protein TetR  39.58 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>