More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7950 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  433  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  70.89 
 
 		 223 aa  278  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  51.21 
 
 		 264 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  51.87 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  48.73 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  46.86 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  47.64 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  50.24 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  43.13 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  41.12 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  45.99 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  32.37 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  30.58 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  42.5 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  35.37 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  38.81 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  38.24 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
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NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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