More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5345 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  62.05 
 
 		 264 aa  251  6e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  65.03 
 
 		 215 aa  235  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  63.19 
 
 		 229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  61.8 
 
 		 184 aa  231  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  55.26 
 
 		 197 aa  201  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  51.81 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  52.2 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  51.1 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  48.73 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  44.04 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  42.64 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  29.53 
 
 		 258 aa  81.3  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 245 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  36.46 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  42.03 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  43.64 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  24.86 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 242 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  47.83 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  39.13 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 216 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  26.13 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 243 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 74 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2179  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  43.4 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>