More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0521 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  430  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  80.1 
 
 		 229 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  60.8 
 
 		 264 aa  244  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  61.93 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  58 
 
 		 210 aa  238  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  65.03 
 
 		 196 aa  235  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  63.84 
 
 		 184 aa  225  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  61.11 
 
 		 197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  52.45 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  53.65 
 
 		 193 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  46.86 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  48.7 
 
 		 195 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  32.38 
 
 		 258 aa  95.1  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  29 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
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NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  27.6 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  45.21 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  50 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  31.08 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  43.08 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  46.55 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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