More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0955 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 208 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  32.8 
 
 		 200 aa  94.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  40.52 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  31.86 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  27.5 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  47.44 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  53.45 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5867  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0832592  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0743  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  37.21 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  42.19 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  33.63 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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