More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1348 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
218 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  54.98 
 
 
223 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
229 aa  175  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  51.87 
 
 
218 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  45.75 
 
 
223 aa  167  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  48.53 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  42.92 
 
 
212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 
184 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  44.04 
 
 
196 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 
210 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  43.63 
 
 
195 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  45.45 
 
 
197 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
201 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
217 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  31.37 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  29.35 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 
239 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 
218 aa  61.6  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  28.5 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  38.54 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 
245 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
209 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
209 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
215 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 
239 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  38.16 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
195 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  36.47 
 
 
200 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
195 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 
181 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
233 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  44.78 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2043  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
414 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal 
 
 
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NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
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NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal 
 
 
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NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
219 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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