More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7862 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 240 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  51.69 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  50.56 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 181 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  48.6 
 
 		 185 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  49.13 
 
 		 197 aa  151  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  55.03 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  52.41 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 178 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.5 
 
 		 178 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 178 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  37.5 
 
 		 178 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 182 aa  138  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 186 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  36.36 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 184 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 184 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  37.79 
 
 		 193 aa  95.9  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  34.1 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 184 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  33.75 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  32.09 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 429 aa  55.1  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  29.63 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  31.18 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  31.18 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  33.08 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 190 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  33.72 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>