91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22570 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  43.03 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  41.72 
 
 		 187 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 182 aa  104  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 240 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 178 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  33.12 
 
 		 178 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.12 
 
 		 178 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  40.27 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 186 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  39.87 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  36.61 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  40.62 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  27.53 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  29.01 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 415 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  30.33 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  26.43 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 184 aa  42  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 189 aa  42  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 203 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 428 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 204 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 184 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 225 aa  41.2  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 226 aa  41.2  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>