More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1451 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  82.06 
 
 		 415 aa  689    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 428 aa  873    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 186 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 181 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 187 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 189 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 177 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 183 aa  97.8  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 187 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 177 aa  94  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 194 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 191 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  34.88 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  32.39 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 187 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 172 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 192 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 184 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 183 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 188 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
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NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 189 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 208 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
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NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 168 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 179 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  33.8 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 185 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 188 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 175 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 188 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 184 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  37.09 
 
 		 186 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  29.87 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 196 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 178 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  32.58 
 
 		 197 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 222 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 200 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 195 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 197 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 206 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 181 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 206 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 213 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 190 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 241 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 182 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  30.9 
 
 		 241 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 237 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 237 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 230 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  53.33 
 
 		 237 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
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NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 223 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 186 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 237 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 212 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 180 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 189 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 181 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.73 
 
 		 178 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 178 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 202 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 186 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
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NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  27.73 
 
 		 178 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
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