More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0763 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  360  6e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  74.73 
 
 		 181 aa  238  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  48.88 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  49.73 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  48.08 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  63.49 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37450  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0726232  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  58.18 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  40.96 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 415 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 244 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  47.54 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 223 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  69.7 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  41.79 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  41.18 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>