More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1498 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  98.94 
 
 
189 aa  377  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  74.87 
 
 
189 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
205 aa  92  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
178 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  56.16 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
208 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
214 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
214 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  59.26 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  33 
 
 
209 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 
415 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 
185 aa  58.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
428 aa  57.8  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 
188 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  31.72 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  45.78 
 
 
179 aa  55.1  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 
230 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 
186 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 
183 aa  54.3  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
244 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
236 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 
141 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  32.28 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  29.09 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
357 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
184 aa  51.6  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 
205 aa  52  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 
182 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 
212 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  28.18 
 
 
187 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 
222 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
209 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
191 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
254 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 
237 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 
183 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  33.7 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  37.76 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 
226 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  34.34 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
183 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 
222 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
207 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.851315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>