More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1153 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  74.33 
 
 		 189 aa  277  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 189 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 194 aa  111  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  61.29 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  38.24 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  52.78 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  53.97 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 415 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  54.24 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  50.94 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  48.57 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  32.35 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 357 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 257 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  33.66 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  51.02 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 332 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 238 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>