More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3260 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  95.72 
 
 		 187 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 186 aa  197  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  39.46 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 357 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 227 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 244 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 208 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 227 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 201 aa  98.2  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 236 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 141 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  32 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  26.74 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  38.96 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31090  transcriptional regulator, tetR family  32.35 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.565118  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  32.67 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  26.8 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4881  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0263857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 230 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 202 aa  51.2  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>