More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1025 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  97.2 
 
 		 214 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  65.57 
 
 		 207 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4141  TetR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 243 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 230 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2636  regulatory protein TetR  39.78 
 
 		 182 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0437  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  41.25 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0230  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 187 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0857  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0874  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 388 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03540  transcriptional regulator, tetR family  43.08 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0863  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 181 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 192 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  45.16 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4093  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370117  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>