101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0437 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0437  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 176 aa  345  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0230  TetR family transcriptional regulator  77.46 
 
 		 189 aa  237  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0863  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0857  TetR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 181 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0874  TetR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 181 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  36.36 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  46.55 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  35.51 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  36.73 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 235 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  36.62 
 
 		 204 aa  45.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 208 aa  44.3  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  18.45 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2999  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.03228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 212 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  35.09 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 189 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  47.73 
 
 		 217 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 219 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 218 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 218 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 218 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 220 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  42  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 200 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 202 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1527  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.718491  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1712  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 231 aa  41.2  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 230 aa  41.2  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 400 aa  41.6  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 191 aa  41.2  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 225 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  41.2  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 230 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 324 aa  40.8  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4141  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 243 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 232 aa  40.8  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 204 aa  40.8  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 200 aa  40.8  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 183 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 215 aa  40.8  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 191 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 191 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>