204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2773 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  386  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  76.04 
 
 		 192 aa  283  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  65.28 
 
 		 193 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  65.28 
 
 		 193 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  65.28 
 
 		 193 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  56.32 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  41.08 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 279 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  40.82 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 205 aa  98.2  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 192 aa  95.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30.89 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  23.37 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 324 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  57.89 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 230 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  35.19 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  26.13 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  40 
 
 		 264 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0595  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 237 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0437  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>