121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0242 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  44.27 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  40.31 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 279 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 193 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 193 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 193 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 192 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  37.27 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  33.5 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  25.65 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  29.06 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  40.38 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  42.31 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  35.54 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  34.62 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  34.62 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 271 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2659  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144734  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2860  regulatory protein, TetR  43.64 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 266 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>