More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5351 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  53.37 
 
 		 196 aa  191  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  51.08 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 195 aa  138  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  34.52 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 243 aa  104  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  36.13 
 
 		 243 aa  104  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 242 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 200 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  30.19 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  32.53 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  25.32 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  28.03 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  23.91 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 400 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3704  regulatory protein TetR  23.72 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 182 aa  51.6  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 418 aa  51.2  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  23.57 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>