177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5414 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  370  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  50.27 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  51.3 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  49.23 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  47.67 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  44.02 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  47.7 
 
 		 279 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  46.54 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  40.15 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  35.04 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 227 aa  72  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  38.24 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  35.97 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 415 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 213 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 213 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  36.78 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 321 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 175 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 213 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  30.77 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0595  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1213  regulatory protein TetR  41.77 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.02381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  21.82 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.77 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.77 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.77 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.77 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.77 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>