More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0855 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  85.28 
 
 		 197 aa  331  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  80.21 
 
 		 197 aa  304  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  80.21 
 
 		 197 aa  304  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  80.21 
 
 		 197 aa  304  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  40.36 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 229 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  30.21 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  45.61 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  38.81 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  32.67 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  40.91 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5813  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393234  hitchhiker  0.00386056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 279 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  35.25 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  36.56 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>