158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4400 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 273 aa  49.3  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  28.81 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 228 aa  48.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 228 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 197 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  32.39 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 228 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 228 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 228 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0210  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 221 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 199 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  41.51 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  31.33 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1038  regulatory protein, TetR  26.67 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0256263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  29.24 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  23.65 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>