More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0441 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  454  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  69.79 
 
 		 321 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  69.44 
 
 		 288 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  68.4 
 
 		 321 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  68.4 
 
 		 321 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  68.4 
 
 		 321 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  68.4 
 
 		 288 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  41.32 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  35.56 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  33.52 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  27.27 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  27.78 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  43.9 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  29.07 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  58.33 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  30.37 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  29.03 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>