More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0718 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  48.7 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  43.58 
 
 		 264 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 194 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  42.58 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  51.49 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  48.51 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  44.04 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  42.2 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5223  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846379 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  34.62 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  38.46 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  28.66 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  55.36 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  33.12 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  35.65 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  32.53 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  57.41 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>