More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3565 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  378  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  47.44 
 
 		 192 aa  130  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 199 aa  127  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  42.41 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5223  putative transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 186 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 186 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  43.97 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  46.73 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 184 aa  90.9  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 192 aa  84.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  47.67 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 264 aa  71.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 243 aa  67  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  45.45 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  58.49 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  39 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  39.18 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  43.42 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  31.71 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  30.61 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  40 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  52.83 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  36 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>