More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6452 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 211 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 192 aa  95.1  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 192 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 193 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  45.3 
 
 		 198 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 189 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 199 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 194 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 191 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  46.73 
 
 		 193 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 187 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  47.57 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  46.79 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5223  putative transcriptional regulator, TetR family  44.86 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  44.55 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  34.51 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  37.96 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  35.51 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 192 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  34.97 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 212 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 214 aa  62  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  33.63 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  33.63 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  33.63 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  33.63 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  33.63 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  37.11 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
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NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
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CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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