More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1036 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  99.65 
 
 		 321 aa  554  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  99.65 
 
 		 321 aa  554  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  99.65 
 
 		 321 aa  554  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  99.65 
 
 		 288 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  99.31 
 
 		 321 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  89.17 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  57.53 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  47.54 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  45 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  51.67 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  41.38 
 
 		 206 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  40.35 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  42.65 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  43.04 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  42.86 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.86 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 203 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  45.28 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.86 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.86 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 193 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.86 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>