More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0987 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  37.08 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  36.25 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  36.25 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  39.29 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  34.62 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  23.77 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1531  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  44.44 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 269 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0891  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 227 aa  52  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.735718  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>