More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3734 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  70.94 
 
 		 290 aa  293  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2452  TetR family transcriptional regulator  66.2 
 
 		 228 aa  291  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0628  TetR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 63 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.823265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  46.75 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 332 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 290 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 196 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
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NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
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NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
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NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
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